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• 316017a575 更新脚本和配置，修复 BUCKy 版本检查逻辑，调整 RAxML 脚本参数，增加 cairosvg 依赖，并更新 pixi.lock 文件以反映新依赖。 master IvisTang 2025-12-24 09:00:15 +0800
• e467d67723 Add scripts for phylogenetic analysis using MrBayes and RAxML IvisTang 2025-12-20 23:33:05 +0800
• dba4833905 更新 .gitignore，添加 06.gene_trees 目录；重构 macse.sh 脚本，移除 fs_lr 参数；删除多个不再使用的脚本；添加 check_frameshift.py 和 get_og_seqs.py 脚本以处理阅读框移位和提取单拷贝OG序列；更新 pixi.toml 和 pixi.lock 文件以添加 paml 依赖。 IvisTang 2025-12-20 01:57:25 +0800
• e8ba2ed962 更新 .gitignore，添加 run.status.json；删除旧的 mapping.sh 脚本并添加新的 01.mapping.sh 脚本 IvisTang 2025-12-17 23:27:49 +0800
• d8888b8589 20251217 IvisTang 2025-12-17 20:22:04 +0800
• 0d31d42de4 Add Vercel configuration for rewrites and build settings IvisTang 2025-12-17 17:47:45 +0800
• 072524e303 20251213 IvisTang 2025-12-13 17:57:57 +0800
• 8bab5cfa52 20251125 IvisTang 2025-11-25 00:44:52 +0800
• cd2628e2b6 20251125 IvisTang 2025-11-25 00:43:15 +0800
• fadc9b5e64 remove embedded git repo IvisTang 2025-11-25 00:34:00 +0800
• eb3f16c30e 20251125 IvisTang 2025-11-25 00:28:51 +0800